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陈玲玲 教授

发布者:重点实验室发布时间:2024-04-07浏览次数:63

助理教授,博士,硕士生导师

邮箱:lxie@gxu.edu.cn

研究方向: 作物表观基因组学

已所属区级或者校级平台名称:作物栽培学与耕作学重点实验


个人简介:

包括人才称号、教育及工作经历,学术任职等。

2015和2021年在华中农业大学生物信息学专业分别获得学士和博士学位


科研成果:

包括主要研究内容,学术成果,代表性论文简介等。

主要从事水稻玉米油菜等表观基因组研究。主要负责构建了水稻的多组织多品系的表观基因组图谱和表观基因组学数据库。参与了油菜玉米等作物的三维基因组互作和表观基因组图谱等研究。近2年来以第一作者身份在Nat Commun、Mol Plant国际权威杂志发表SCI论文2篇。


科研项目:

(1) 国家自然科学基金委员会, 面上项目, 31771422, 水稻三维基因组结构及其与表观遗传修饰的关系研究, 2018-01-01至2021-12-31, 65万元, 在研, 参与

(2) 国家自然科学基金委员会, 青年科学基金项目, 31701163, 植物eChIP-seq技术的建立与甘蓝型油菜表 观基因组图谱的构建, 2018-01-01至2020-12-31, 25万元, 结题, 参与


代表性论文:

1. Xie,L., Liu, M., Cao, K., Wang, P., Xu, W., Li,X., & Li,G. RiceENCODE: a comprehensive rice Encyclopedia of DNA Elements database. Molecular Plant 2021, 14(10): 1604-1606

2. Zhao, L#., Xie, L#., Zhang, Q#., Ouyang, W. Z., Deng, L., Guan, P. P., Ma, M., Li, Y ., Zhang , Y., Xiao, Q., Zhang, J. W., Li, H. M. J., Wang, S. Y., Man, J. W ., Cao, Z. L., Zhang, Q. H., Zhang, Q. F., Li, G. L.& Li, X. W. (2020). Integrative analysis of reference epigenomes in 20 rice varieties. Nature communications, 11(1), 1-16.

3. Zhao, L., Wang, S. Q., Cao, Z. L., Ouyang, W. Z., Zhang, Q., Xie, L., Zheng, R. Q., Guo, M. R., Ma, M., Hu, Z., Sung, W. K., Zhang, Q. F., Li, G. L.& Li, X. W. (2019). Chromatin loops associated with active genes and heterochromatin shape rice genome architecture for transcriptional regulation. Nature communications, 10(1), 1-13.

4. Peng, Y., Xiong, D., Zhao, L., Ouyang, W. Z., Wang, S., Sun, J., Zhang Q., Guan, P. P., Xie L., Li, W. Q., Li, G. L. & Li, X. W. (2019). Chromatin interaction maps reveal genetic regulation for quantitative traits in maize. Nature communications, 10(1), 1-11.

5. Zhang, Q., Guan, P., Zhao, L., Ma, M., Xie, L., Li, Y., Zheng, R., Ouyang, W., Wang, S., Li, H., Zhang, Y., Peng, Y., Cao, Z., Zhang, W., Xiao, Q., Xiao, Y., Fu, T., Li, G., Li, X., & Shen, J. (2021). Asymmetric epigenome maps of subgenomes reveal imbalanced transcription and distinct evolutionary trends in Brassica napus. Molecular plant, 14(4), 604–619.


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