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宋佳明

发布者:华南农业大学发布时间:2022-04-17浏览次数:10

宋佳明副教授,博士,博/硕士生导师

邮箱:jmsong@gxu.edu.cn

研究方向: 生物信息学,作物基因组,生物数据库平台


个人简介:

2020.08-至今 广西大学生命科学与技术学院 预聘副教授

2015.09-2020.07华中农业大学理学博士学位(生物信息学)

2019.02-2020.02美国亚利桑那大学博士联合培养 (基因组学)

2012.03-2015.06华中科技大学工学学士学位(辅修计算机科学与技术)

2011.09-2015.06华中农业大学理学学士学位(生物信息学)


科研成果:

      主要从事植物泛基因组学和比较基因组学研究。在国际上率先完成水稻无缺口参考基因组图谱的构建,完整解析了水稻着丝粒的序列特征,完成了多个甘蓝型油菜参考基因组和泛基因图谱,开发了基于插入/缺失变异(PAV)的全基因组关联分析新方法解析了油菜重要表型差异的结构变异,揭示了甘蓝型油菜生态型分化的遗传与分子基础,开发了籼稻、油菜和玉米等基因组生物信息平台和数据库。以第一作者(含共同)在Nat Plants、Mol Plant、Plant Biotechnol J等国际权威杂志发表SCI论文6篇。


科研项目:

国家自然科学基金青年项目(2022.1-2024.12),基于全长转录本测序研究水稻冷诱导可变剪切的调控机制(32100526),直接经费30万元(主持)


代表性论文:

1. Song, J. M.#, Xie, W. Z.#, Wang, S.#, Guo, Y. X., Koo, D. H., Kudrna, D., Gong, C., Huang, Y., Feng, J. W., Zhang, W., Zhou, Y., Zuccolo, A., Long, E., Lee, S., Talag, J., Zhou, R., Zhu, X. T., Yuan, D., Udall, J., Xie, W., Wing R.A., Zhang Q., Poland J., Zhang J., Chen L. L. (2021). Two gap-free reference genomes and a global view of the centromere architecture in rice. Molecular plant, 14(10), 1757–1767. (IF: 12.084)

2. Song, J. M.#, Guan, Z.#, Hu, J.#, Guo, C., Yang, Z., Wang, S., Liu, D., Wang, B., Lu, S., Zhou, R., Xie, W. Z., Cheng, Y., Zhang, Y., Liu, K., Yang, Q. Y., Chen, L. L. & Guo, L. (2020). Eight high-quality genomes reveal pan-genome architecture and ecotype differentiation of Brassica napus. Nature Plants, 1-12. (IF: 13.256)

3. Song, J. M.#, Zhang, Y.#, Zhou, Z. W., Lu, S., Ma, W., Lu, C., Chen, L. L., & Guo, L. (2021). Oil plant genomes: current state of the science. Journal of experimental botany, erab472. (IF: 6.992)

4. Song, J. M., Lei, Y., Shu, C. C., Ding, Y., Xing, F., Liu, H., Wang, J., Zhang, J. W. & Chen, L. L. (2018). Rice information GateWay: a comprehensive bioinformatics platform for Indica Rice genomes. Molecular Plant, 11(3), 505-507. (IF: 12.084)

5. Song, J. M.#, Liu, D. X.#, Xie, W. Z., Yang, Z., Guo, L., Liu, K., Yang, Q. Y., & Chen, L. L. (2021). BnPIR: Brassica napus pan-genome information resource for 1689 accessions. Plant biotechnology journal, 19(3), 412–414. (IF: 8.154)


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