夏瑞教授团队在《Molecular Plant》发表生物信息学软件TBtools
作者: 来源:亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室 浏览数:15 录入:2020-07-02


   近日,华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室、岭南现代农业科学与技术广东省实验室、园艺学院夏瑞教授课题组在国际主流学术期刊 Molecular Plant在线发表了题为“TBtools - an integrative toolkit developed for interactive analyses of big biological data”的研究论文(https://www.cell.com/molecular-plant/fulltext/S1674-2052(20)30187-8),介绍了该课题组开发的一款生物信息学软件 TBtools,旨在填补生物学研究和生物信息学软件开发之间被无意忽视的需求缺口:1)实验人员自主完成分析小任务的可能;2)功能调用的直观友好和操作的便利;3)开箱即用和多功能的集成;4)发表级图形的准备与可交互操作,等。


   当前正是生物大数据时代,更好的分析和解读这些数据,已然是生物学科研工作者,尤其是以湿实验课题为主的研究人员所面临的挑战。TBtools通过提供130多个实用,便捷且优化的功能,提供了一套较好的应对策略。文稿中,作者介绍了TBtools的主要功能(包括10个常用功能)及其功能集成性和图表交互性。

 TBtools软件目前已有一定用户基础(用户量超过15,000),20201月至今被300多项工作所引用(日均被引两次)。广泛的用户基础,使得TBtools得以充分的改进和优化。作者团队相信,该软件可在较大程度上降低生物信息学数据分析门槛,为生物学科研工作者节省更多时间和精力。

 论文通讯作者为夏瑞教授,第一作者是博士研究生陈程杰。华南农业大学园艺学院何业华教授,陈浩博士(现任职于湖南农业大学),张翼老师以及康奈尔大学Margaret H. Frank教授和Hannah R. Thomas博士参与了该项工作。工作得到国家重点研发计划和国家自然科学基金委员会的资助。









 
 
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