张积森教授，博士，博/硕士生导师
邮箱：zjisen@126.com
研究方向：
1. 甘蔗种质资源的演化及其精确评价；
2. 甘蔗糖分代谢、生物量形成、C4光合途径以及抗旱等重要生物学性状相关基因挖掘与分子调控机理解析；
3. 甘蔗分子育种关键基因及相关标记，应用基因聚合创制优异种质资源，选育甘蔗突破性品种选育。
个人简介：
国家青年人才计划入选者，福建省高层次人才（C类（2020年），B类（2022年）），福建省高校“新世纪优秀人才支持计划”入选者，福建十四届青年科技奖获得者。 2007年获得福建农林大学理学博士；2007年-2016年工作关系在福建师范大学生命科学学院，其间2008年-2012年在美国伊利诺伊大学厄本那-香槟分校（UIUC）从事博士后研究工作；2013.01 科研工作转入福建农林大学，受聘福建农林大学基因组与生物技术研究中心（现基因组学中心）教授、博士生导师、常务副主任；2016.10 工作关系调入福建农林大学。2022年12月任广西大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室主任。
科研成果：
2004年以来主要从事以甘蔗为主的热带、亚热带作物基因组及其生物学性状研究，特别对甘蔗的基因组学及其重要性状的分子生物学进行了有系统的研究。近十年带领团队以甘蔗分子育种为目标，取得一定的学术成绩：1）国际上首次完成了甘蔗属核心材料的全基因组图谱，引领甘蔗研究进入后基因组时代。2）取得甘蔗原始种种质资源演化和遗传学领域突破性进展，回答了甘蔗研究领域的两个基础科学问题。3）系统鉴定了原始种种间糖分、光合等生物学性状相关的差异关键基因。主要研究结果2次发表在《自然遗传学》 (Nature Genetics)杂志（2018，2022）和1次发表在《自然植物学》（Nature Plants, 2023）。
先后主持国家重点研发项目课题（甘蔗）、863子课题、国家重点研发项目子任务、国家自然基金、福建省重大专项课题等研究项目20项；参与国家自然科学基金项目和农业部项目等项目10项。在Cell, Nature Genetics, PNAS, Genome Research，Genome biology，Nature communications, Molecular Plant等刊物上发表各类文章130多篇，是2016-2020年农业基因与遗传学全球Top100高产作者。共同主编教材1部，副主编教材2部。
主要在研项目：
1. 国家自然科学基金面上项目，甘蔗镁离子转运蛋白调控光合的分子机制研究，2022-2026，54万元，主持。
2. 国家重点研发计划项目，主要经济作物优异种质资源形成与演化机制，2021-2025，846万元，主持(甘蔗方向)。
3. 福建省专项经费，巨菌草基因组及光合特征。50万。2021-2023，主持；
4. “十四五”福建省种业创新与产业化工程项目子课题。30万。2021-2024年，主持。
近五年代表性论文(10篇)：
1) Tianyou Wang*, Baiyu Wang*, Xiuting Hua*, Haibao Tang*, Zeyu Zhang, Ruiting Gao, Yiying Qi, Qing Zhang, Gang Wang, Zehuai Yu, Yongji Huang, Zhe Zhang, Jing Mei, YuhaoWang, Yixing Zhang, Yihan Li, Xue Meng, Yongjun Wang, Haoran Pan, Shuqi Chen, Zhen Li, Huihong Shi, Xinlong Liu, Zuhu Deng, Baoshan Chen, Muqing Zhang, Lianfeng Gu, Jianping Wang, Ray Ming, Wei Yao†, Jisen Zhang†.A complete gap-free diploid genome in Saccharum complex and the genomic footprints of evolution in the highly polyploid Saccharum genus. (2023). Nature Plants. 10.1038/s41477-023-01378-0.
2) Huakun Zheng, Baiyu Wang, Xiuting, Hua, Ruiting Gao, Yuhao Wang, Zixin Zhang, Yixing Zhang, Jing Mei, Yongji Huang, Yumin Huang, Hui Lin, Xingtan Zhang, Dongmei Lin, Siren Lan, Zhongjian Liu, Guodong Lu, Zonghua Wang*, Ray Ming*, Jisen Zhang*, Zhanxi Lin*. A near-complete genome assembly of the allotetrapolyploid Cenchrus fungigraminus (JUJUNCAO) provides insights into its evolution and C4 photosynthesis. （2023）Plant communications. doi: 10.1016/j.xplc.2023.100633. Epub ahead of print. PMID: 37271992.
3) Qing Jiang†, Xiuting Hua†, Huihong Shi†, Jia Liu, Yuan Yuan, Zhen Li, Shuangyu Li, Meiqing Zhou, Chongyang Yin, Meijie Dou, Nameng Qi, Yongjun Wang, Muqing Zhang, Ray Ming, Haibao Tang, and Jisen Zhang*. Transcriptome dynamics provides insights into divergences of photosynthesis pathway between Saccharum officinarum and Saccharum spontaneum. (2023) The Plant Journal. DOI: 10.1111/TPJ.16110.
4) Qing Zhang#, Yiying Qi#, Haoran Pan#, Haibao Tang#, Gang Wang, Xiuting Hua, Yongjun Wang, Lianyu Lin, Zhen Li, Yihan Li, Fan Yu, Zehuai Yu, Yongji Huang, Tianyou Wang, Panpan Ma, Meijie Dou, Zongyi Sun, Yibin Wang, Hengbo Wang, Xingtan Zhang, Wei Yao, Yuntong Wang, Xinlong Liu, Maojun Wang, Jianping Wang, Zuhu Deng, Jingsheng Xu, Qinghui Yang, ZhongJian Liu, Baoshan Chen, Muqing Zhang, Ray Ming, Jisen Zhang*. Genomic insights into the recent chromosome reduction of complex autopolyploid sugarcane S. spontaneum. (2022). Nature Genetics. 10.1038/s41588-022-01084-1.
5) Qing Zhang†, Xiuting Hua†, Hong Liu†, Yuan Yuan, Yan Shi, Zhengchao Wang, Muqing Zhang, Ray Ming, Jisen Zhang*. Evolutionary Expansion and Functional Divergence of Sugar Transporters in Saccharum (S. spontaneum and S. officinarum). (2020).The Plant Journal. doi.org/10.1111/tpj.15076.
6) Duo Chen†, Qing Zhang†, Weiqi Tang†, Zhen Huang†, Gang Wang†, Yongjun Wang, Jiaxian Shi, Huimin Xu, Lianyu Lin, Zhen Li, Wenchao Chi, Likun Huang, Jing Xia, Xingtan Zhang, Lin Guo, Yuanyuan Wang, Panpan Ma, Juan Tang, Gang Zhou, Min Liu, …, Ray Ming, Marc Van Montagu*, Haibao Tang*, Yves Van de Peer*, Youqiang Chen*, and Jisen Zhang*. The evolutionary origin and domestication history of goldfish (Carassius auratus).(2020)Proceedings of the National Academy of Sciences USA..10.1073/pnas.2005545117.
7) Zhen Li, Xiuting Hua, Weiming Zhong, Yuan Yuan, Yongjun Wang, Zhengchao Wang, Ray Ming, Jisen Zhang*(2020). Genome-Wide Identification and Expression Profile Analysis of WRKY Family Genes in the Autopolyploid Saccharum spontaneum. Plant Cell Physiology. 10.1093/pcp/pcz227.
8) Jisen Zhang*#, Xingtan Zhang#, Haibao Tang#, Qing Zhang#, Xiuting Hua, Xiaokai Ma, ....,Chifumi Nagai*,Ray Ming*. Allele-defined genome of the autopolyploid sugarcane Saccharum spontaneum L.. (2018) Nature Genetics, DOI: 10.1038/s41588-018-0237-2.50 : 1565–1573.
9) Zhang Jisen, Zhang Qing, Li Leiting, Tang Haibao, Zhang Qiong, Chen Yang, Arro Jie, Zhang Xingtan, Wang Aiqin, Miao Chenyong, Ming Ray*. (2018) Recent Polyploidization Events in Three Saccharum Founding Species. Plant Biotechnology Journal. https://doi.org/10.1111/pbi.12962.
10) Weichang Hu#; Xiuting Hua#; Qing Zhang; Jianping Wang; Qiaochu Shen; Xingtan Zhang; Kai Wang; Qingyi Yu; Yann-Rong Lin; Ray Ming; Jisen Zhang*(2018). New Insights into the Evolution and Functional Divergence of the SWEET family in Saccharum based on Comparative Genomics. BMC Plant Biology. DOI: 10.1186/s12870-018-1495-y.
